Кубок России по футболу 2008/2009 — футбольный турнир, который проводится по системе с выбыванием, начиная с 1/512 финала. Финал турнира состоится в Химках на стадионе "Арена Химки" 31 мая 2009 года. Победитель получит право сыграть в Лиге Европы 2009/2010 (групповой этап), а также сыграть с чемпионом России 2008/2009 в матче за Суперкубок России. Действующим обладателем трофея является "ЦСКА".